اولين واحد هدايت كننده در مركز مشاوره، واحد پذيرش مي باشد. اين واحد هماهنگي هايي جهت استفاده بهينه مراجعين مركز از خدمات روانشناختي، و نيز ارائه خدمات غني تر متخصصين مركز به مراجعين، ايجاد مي نمايد. مهمترين رسالت پذيرش كمك به ايجاد و حفظ آرامش مراجعه كنندگان و سامان دهي به ارائه خدمات مركز به شكل منظم و تخصصي مي باشد.
تحقيقات نشان ميدهد مشكلات آموزشي مهمترين مسايل استرس زا براي دانشجويان به شمار مي رود. از طرفي بر اساس نتايج پژوهشها، مهمترين عوامل پيش بيني كننده سازگاري دانشجويان با محيط جديد به ويژه دانشگاه، ارتباط خانوادگي آنهاست. حمايت خانواده رابطه مثبتي با رضايت از زندگي در دانشجويان و رابطه منفي با احساسات وعواطف منفي مانند تنهايي، اضطراب و افسردگي آنان دارد.
مشاوره گروهي فرایندي است که در آن یک گروه همسان از مراجعين، با كمك مشاور به بررسی رفتارها، احساسات، باورها، نگرش‌ها و ارزش‌هاي خود می‌پردازند تا با اصلاح يا تعدیل آن ها، در مورد حل مسایل و مشکلات خود، اقدامات مؤثرتري انجام دهند.
در مشاوره فردی، روانشناس يا مشاور با رعايت اصل رازداري به مراجع كمك مي كند تا با تعريف و درك دقيق تر از مسايل خود، راه كار هاي مؤثري را كشف كند. تیم تخصصی مرکز مشاوره دانشگاه شامل روانشناس بالینی، مشاورخانواده، مشاور ازدواج و مشاورتحصیلی است. این خدمات در تمامی روزهای هفته در دفتر مرکزي مشاوره و دفاتر مشاوره در خوابگاه هاي دانشگاه ارائه می شود.
مددکاری اجتماعی به دانشجو (یک فرد یا گروه یا جامعه) کمک می‌کند مشکل خود را شناخته و به توانایی‌های خود پی ببرد و با استفاده از منابع و امکانات موجود در جهت حل مشکل خود برآید. او با ایجاد رابطه مبتنی بر اعتماد با مراجعه کنندگان و خانوادههای آنها و به دور از هر گونه پیشداوری و قضاوت، مسئول سازماندهی و مدیریت برنامه های حمایتی و کمک کردن به آن ها برای دریافت خدمات مورد نیاز و مناسب جهت داشتن زندگی بهتر و رفاه بیشتر است.
ارتقای بهداشت روان دانشجویان و دانشگاهیان در گرو اهداف و برنامه هايي است كه پشتوانه مطالعاتي و تحقيقاتي داشته باشد. اين مطالعات به منظور بررسي وضعيت موجود و رسيدن به وضعيت مطلوب، از طريق واحد پژوهش مركز مشاوره دانشگاه انجام مي شود. پژوهش ها در قالب هاي مختلف از جمله طرح های ملي مصوبه وزارت خانه و طرح هاي مستقل مرکز مشاوره، به شيوههاي غربالگري، شيوع شناسي، مقايسهاي، مداخلهاي، كيفي و....اجرا مي شود. اين واحد همچنين آماده همكاري با پژوهشگران دراجراي مطالعات مرتبط با اهداف مرکز مشاوره در حوزه ی بهداشت روان مي باشد.
پشتیبانی و حمایت ذهنی، روانی و اجتماعی دانشجویان نیازمند آموزش و پرورش مهارت ها و توانمندی های روانی و اجتماعی جهت ورود به دنیای کار و زندگی می باشد تا در کنار پیشگیری از آسیب های احتمالی، ارتقای بهداشت روان فردی و اجتماعی دانشجویان در محیط های دانشگاهی تأمین گردد. به همين منظور اين واحد اقدام به برگزاري دوره هاي آموزشي با عناوین مختلفی نظیر: مهارت های زندگی، مهارت هاي معنوي، فضاي مجازي، ارتقاء كيفيت زندگي، ازدواج، مهارت هاي شغلي- تحصيلي و... مي نمايد.
اگر چه احتمالاً ضرورت تأسيس مركز مشاوره در دانشگاه به گذشته هاي دور باز مي گردد و همزمان با اولين سال هاي تأسيس دانشگاه احساس شده است، همچنين بعضاً توسط اساتيد و دلسوزان دانشگاه به نوعي امر راهنمايي دانشجويان نيز صورت مي گرفته است، اما اولين قدم جدي در اين زمينه به بخشنامه آقاي دكتر محمد فرهادي، وزير وقت فرهنگ و آموزش عالي در سال 1367 باز مي گردد كه بدنبال آن در سال 1368 دانشگاه صنعتي اصفهان از پيشگامان ايجاد مركز مشاوره اقدامات اجرايي اوليه در اين زمينه را به عمل آورده است.